水獭的主要药用部位为其肝，药材名为獭肝。其足、肉、骨、皮毛、胆亦供药用，药材名分别为獭四足、獭肉、獭骨、獭皮毛、獭胆。
獭肝 性平、味甘咸。具有养阴、除热、宁嗽、止血等功能。主治虚劳、骨蒸潮热、盗汗、咳嗽、气喘、咯血、夜盲、痔疮下血等病症。
獭四足 可用于手足皮皲裂和食鱼骨鲠的治疗。
獭肉 主治虚劳骨蒸，水肿胀满，二便秘涩，妇女经闭等疾病。 獭骨 主治呕吐不止和食鱼骨鲠。
獭皮毛 能治疗水阴病。
獭胆 可用于眼翳黑花，视物不明，结核瘰疬等疾病的治疗。
水獭皮针毛油亮，弹性极好，外观华丽，手感轻柔，皮板坚韧，底绒丰厚，几乎不为水浸湿，保温性能极强，是制作名贵大衣、领子、帽子的上等原料，具有较高的经济价值。
