一、忌空腹饮用
蜂蜜菊花茶不能长期空腹饮用，原因是蜂蜜菊花茶中含有大量有机酸等酸性物质，若长期空腹饮用易因胃酸过多而引发胃溃疡等胃肠疾病，从一天来看喝蜂蜜菊花茶的最佳时间是饭后1～2小时，尤其是下午2～3点喝杯蜂蜜菊花茶不但能提神醒脑，更能缓解因用眼过度而导致的眼部干涩、疲劳等症状。
二、忌过量饮用
蜂蜜菊花茶不能长期过量饮用，原因是蜂蜜菊花茶中含有大量的葡萄糖和果糖等单糖，虽然单糖相对于其他糖类而言较不易转化成脂肪，但这并不是说单糖就完全不能转化成脂肪，事实上长期过量喝蜂蜜菊花茶也极易因单糖摄入过量而引起肥胖，严重时甚至可能因过度肥胖而诱发糖尿病等代谢疾病。
三、忌高温冲泡
蜂蜜菊花茶不能直接用开水冲，原因是蜂蜜中含有大量酶类等活性物质，而活性物质恰恰又是蜂蜜最具代表性的营养物质，但这些活性物质对温度非常敏感，例如温度超过60℃时大量活性物质便将永久失去活性，因此冲蜂蜜菊花茶时要先将菊花冲泡成菊花茶并等菊花茶温度降到60℃以下时再加蜂蜜。
四、寒凉体质慎饮
蜂蜜菊花茶不适合寒性体质的人群饮用，原因是菊花本身就是寒性的，若寒性体质人群饮用极易引发身体不适，例如脾胃虚寒的人群饮用可能引起腹痛、腹泻等不适，而畏寒怕冷的人群饮用则可能更加畏寒怕冷，另外有痛经等问题的女性喝蜂蜜菊花茶也要谨慎，事实上很多女性痛经都是宫寒引起的。
五、忌饮隔夜茶
蜂蜜菊花茶隔夜后不建议再饮用，原因是蜂蜜菊花茶中富含绿原酸、维生素等天然抗氧化物质，喝新鲜蜂蜜菊花茶能增强人体内抗氧化酶的活性并能抑制自由基的氧化能力，但隔夜后蜂蜜菊花茶中的抗氧化物质会被氧化并失去抗氧化作用，同时蜂蜜菊花茶中富含的葡萄糖和果糖等糖分还易滋生细菌。
六、过敏体质慎饮
蜂蜜菊花茶要提防过敏反应，原因是蜂蜜菊花茶对少数过敏体质人群而言是过敏原，这类人群喝蜂蜜菊花茶后易引发皮肤红肿、红疹等过敏反应，严重时可能引起呼吸困难、惊厥甚至过敏性休克，因此饮用之前一定要确保自己不对蜂蜜菊花茶过敏，若已发生过敏则要服用抗过敏药物并前往医院就医。
