亚麻生长期间，每生产1g干物质需消耗水分400-430g。种子需吸收本身质量107-155%的水分才能萌发，从出苗到开花期，如土壤持水量低于40%将使亚麻受旱，对麻茎和纤维的影响极大，尤其是快速生长期到末花期最为敏感。冬亚麻生长期正值冬春干旱少雨季节，因此，要根据土壤墒情和亚麻生长状况，于播种后2天内、枞型期、快速生长期、开花期、成熟期酌情辅以人工灌溉，保持土壤田间持水量在65-75%之间为宜。如遇特殊干旱年份，要及时做好亚麻生产的抗旱工作，实现抗旱减灾，抗旱保收。
1、在有条件的地区要及时早进行沟灌保苗，引水到厢沟，灌水到沟深的2/3，让水漫漫渗透到厢面，切忌淹灌、漫灌和久灌；施肥要与灌水相结合。
2、中度干旱田块，可采用叶面喷施浓度为1000-1200倍液的黄腐酸（又名抗旱剂1号、ＦＡ“绿野”）的方法，可以减少水分蒸发、增加绿叶面积、茎秆强度，提高叶绿素含量，增强植株抗逆能力。
3、对引水抗旱确有困难的田块，应在阴天或下午阳光变弱时，采取人工喷施0.3%尿素、0.3%磷酸二氢钾、0.2%硼砂混合液2-3次，隔5-7天1次，补充营养、增强植株抗性。
4、在干旱情况下，亚麻苗势弱，抵抗力下降，一些病虫害易发生危害，应积极加强防治，主要病害为白粉病，在发病初期，可选用40%福星乳油8000-10000倍液、或40%信生可湿性粉剂4000倍液、或50%粉锈清悬浮剂800倍液进行喷雾防治，7-10天一次，连喷2-3次；主要虫害有粘虫、甜菜夜蛾、甘兰夜蛾等，可选用敌杀死、功夫等菊酯类或有机磷类杀虫剂，在幼虫2-3龄期进行喷雾防治。
