红小豆的病害主要有病毒性病害、真菌性病害和细菌性病害。
1、红小豆花叶病毒病。该病严重时颗粒无收。患病株主要症状为叶片皱缩和花叶；小叶皱缩丛生、叶脉发黄、茎和叶脉上有坏死备纹；叶片畸形、叶肉隆起、植株矮小、不能开花结荚。
2、红小豆锈病。茎叶荚均会被侵染。叶片上染病初期有褪绿色的小圆斑，然后病斑形成突起的黄褐色或暗褐色镑疱状的夏孢手堆，破裂后散出锈状夏孢子，因阳光有杀苗作用，故叶背面病斑膏最多，严重时叶片由黄变枯而脱落；茎秆和荚上的镑斑与叶片上的镑斑相似。病菌孢子可借风雨在田间传播，因此红小豆播种旱最易得锈病。
防治方法：（1）选育抗病品种。（2）轮作。（3）间套作。（4）药剂防治。在发病初期用0.001%的粉锈灵药液进行喷洒，有效享高达85%～90%。
3、红小豆角斑病。主要危害叶片，但也侵害叶柄、茎和荚等部位。主要症状为叶片发病初期，叶背出现褪色小点彳艮快扩大成水渍状透明病斑，后变成黑褐色，病斑因受叶脉限制而呈多角形或不规则形。以后病斑部变灰褐色，坏死，常常撕裂脱落。有时病斑沿叶脉呈长条弯曲状黑褐色病斑。严重时叶片上病斑密布，连成不规则的褐色枯死大斑块。茎和荚上发生的病斑与叶片上的相似。该病由种手带病传染，风雨和农具传播。发病最适温度30℃，致死温度50℃。
防治办法：（1）合理轮作、间套作。（2）清除病残植株。（3）药剂防治：用500倍代森锌或1000倍多菌灵液及160倍等量波尔多液喷洒。间隔7～10天喷1次。
红小豆的虫害主要有蚜虫、豆荚螟、豆象等。
4、蚜虫防治，蚜虫成由分为有翅和无翅两种体型。有趣蚜虫可以迁飞。所以大面积治蚜时必须及时喷洒农药。可用40%氧化乐粟乳剂1000～1500倍或50%磷胺乳剂3000～5000倍液或50%西维因可湿性粉剂400倍液。喷粉可用1.5%乐粟粉剂、2%杀螟粉剂或2.5%亚胺硫磷粉剂，每亩1.5～2千克。
5、豆荚螟防冶，必须在幼虫未钻进豆荚对进行药剂防治。可用吊2.5%敌百虫粉每亩1.5千克，或50%杀螟松乳剂800～1000倍液，或90%晶体敌百虫800～1000倍液喷雾。
6、豆象防治。豆象的幼电主食豆粒，严重时会完全被吃光。有时豆粒上有一个或几个孔，失去食用价值。可用药物熏蒸法进行防治。溴甲烷每立方来30克计，在室温20℃以上时密闭熏蒸2～3天，在20℃以下时熏蒸3～5天，然后开窗通风2～3天，2周后方可食用，以免中毒。
