优选种子用于培育萝卜芽菜的种子，应选择生长势优、抗病性强、品质好的萝卜品种，如大红袍、绿肥萝卜、穿心红等。种子要求是当年的，且整齐一致、籽粒饱满、无病残。
浸种催芽先将萝卜种子清洗干净，再在室温下用多于种子3倍的清水浸泡8―10小时（期间需用流动的清水将种子冲洗1―2次，每次以冲至澄清为度），然后将种子置于23―26℃的条件下催芽。待种子露出胚根3―5厘米时，即可播种。
播种方式育苗盘和苗床均可播种。育苗盘要求底面平整、坚固耐用，且通透性好；栽培基质可选用白棉布或包装纸。播种前先将育苗盘清洗干净、进行消毒，再铺上层栽培基质，然后将种子均匀地撒在育苗盘中的基质上（每盘播种100―150克）。播好种后，将育苗盘摆放到栽培架上即可。苗床最好是选择疏松、肥沃且排水性能良好的沙壤土地块，播前先要浇透水，然后采用撒播的方式将种子均匀地撒在苗床上（每平方米播种150―250克）。播好种后，覆盖一层1厘米厚的疏松细土。
苗期管理主要是应注意温度和光照的合理调控及通风，以保证芽菜的产量和品质。萝卜芽菜苗期的生长温度应控制在20―25℃，通风降温时要注意不可让风直接吹到芽苗上。由于萝卜芽菜苗对光照的要求不高，故一般条件下即可。育苗盘播种的，应每天倒盘1次（上、下、前后地倒），使芽苗受光一致、生长整齐；反之，若光照过强，则产品因纤维含量高而影响口感。萝卜芽菜苗对湿度的要求是：采用育苗盘播种的，应保持盘中基质湿润但不能聚水，室内空气湿度应控制在80％左右（可采用喷水或喷雾的方式进行调节）。采用苗床播种的，当幼苗长至3厘长时方可浇水，并应注意用水小而勤，以免烂苗。此外，在管理过程中，若发现病苗要及时检出，以防止病害蔓延；病害严重时，可用多菌灵2000倍液喷雾防治。
适时采收育苗盘栽培的，当萝卜芽苗长至1厘米以上时，即可整盘出售，盘可回收后再用。苗床栽培的，当芽菜苗呈翠绿色，苗高8―10厘米，子叶平展、充分肥大、有火柴棒粗时便可采收。采收时连根拔起，清洗后立即包装上市，以避免芽苗发黄而降低品质。
