黑毛豆适宜贮藏温度为8℃～10℃，温度过低易遭冻害，表现为豆荚上有凹陷的锈病，有的呈水渍状病斑块随即腐烂。
气调贮藏的气体成分为氧气2%～3%，二氧化碳低于10%。常用贮藏方法如下：
冷却贮藏法
把清洗的毛豆投入100℃沸水中漂烫2分钟左右，捞起后立即放入冷却水中冷却至室内温度，沥干水分装入塑料袋内，排出空气。将塑料袋放入-25℃的速冻库中，充分冻结后，放在-18℃的贮藏袋中，可长期存放，一般以半年至一年为限。
小包装贮藏法
将豆粒放入0.01毫米聚乙烯塑料袋内，每袋5千克，密封膜口，袋内加消石灰0.5～1千克，贮藏在冷库内，用0.01毫升/升仲丁胺熏蒸防腐，贮藏温度为8℃～10℃，每10～14天开袋检查1次，此法可贮藏30天左右。
