一、烧心生育前期较少出现，一般主要发生在11-12片叶时，发病原因主要是由缺钙引起的。夏季栽培的芹菜易发生烧心，防治方法：主要从管理入手，做到温度、湿度适当，对酸性土壤要施入石灰，把土壤的酸碱性调到中性；发病初期可喷洒0.5%硝酸钙水溶液。
二、空心发病原因：是一种生理老化现象，多发生在沙壤土地上，一般发生在植株生长的中后期。此外，土壤干旱，芹菜受冻也易空心。防治方法：应选择非沙性土壤，施足腐熟有机肥，适时追肥，发现叶色浅、脱肥时，可喷洒0.1%尿素水溶液2-3次。
三、叶柄开裂发病原因一是缺硼引起的，二是在低温、干旱条件下，生长受阻所致。此外，突发性高温、多湿，植株吸水过多，造成组织快速充水，容易开裂。防治方法：一是施足充分腐熟有机肥，每亩施硼砂1公斤，与有机肥充分混匀；二是叶面喷施0.1%-0.3%硼砂水溶液。管理中注意均匀浇水。
