（1）土窖吊藏或搁板架藏吊藏是从窖内一排排相距50厘米的横梁上系着长约1．5～2米的粗麻绳或市带，每三根为1组。绳或布带每50厘米打一个死结。瓜就放在这三根绳或布带打给后形成的兜内，果柄向上。挂后每7～15天检查一次，除去瓜顶变软的瓜。采用搁板贮藏时，每层隔板只摆一层瓜，定期翻瓜，防止瓜与木板接触处腐烂。哈密瓜贮藏初期注意在夜间气温降低后吹风排风，贮藏后期空气相对湿度要保持在85％～90％之间。
（2）气调贮藏采用抽氧灌氮的方法使装果的聚乙烯醇薄膜袋内氧浓度降低，二氧化碳浓度提高，抑制果品呼吸，延长贮藏时间。气体含量要求氧3％～5％，二氧化碳1％～1.5％。相对湿度80％左右，温度3～4℃。
（3）抽气贮藏抽气贮藏是先把放瓜的聚乙烯醇袋扎紧，抽出袋内空气，使袋壁紧贴瓜上，定期换气。聚乙烯醇薄膜能透水而不透气，可以防止袋内湿度过高和结露。
（4）哈密瓜冷库贮藏将纸箱架离地面15～30厘米，堆高10～20箱。早、中熟品种的贮藏适温为5～SC，晚熟品种为3～4C。贮藏期间空气相对湿度保持在85％～90％，过湿易长霉，过干会引起干缩。
（5）涂料贮藏用1000ppm托布津、苯并噻唑44号浸瓜3分钟，晾干，再用1号虫胶涂料加水4倍涂抹，晾干装箱（木箱或纸箱），在地窖或冷库中贮藏。哈密瓜贮藏条件：温度2～3℃，相对湿度80％～85％。
