与之形成鲜明对比的是，2005年仅检验检疫出口荔枝1766.6吨、113.8万美元，同比减少37.9％和51.1％，其中输日比重也由往年的70％左右降至不足20％。
造成日本市场萎缩的主要原因是农残问题。因从中国冷冻荔枝中接连发现甲胺磷农药残留超标，日本对中国荔枝实施甲胺磷残留“命令检查”（及批批检查）。这不但使符合日方要求的出口荔枝货源受限，而且由于日方指定的检测机构数量较少，进口商等待检验、通关的时间长达十几天，不但检验和滞港费用昂贵，而且保鲜荔枝品质下降，进出口商蒙受很大损失。
福建国检局将扩大荔枝出口列为今年重点工作目标之一，并采取三条措施：
一是继续全面实施出口果园备案制度，加强农残源头管理，保障出口荔枝安全卫生质量；
二是指导、鼓励企业开展出口荔枝热处理和冷处理技术研究，扩大保鲜荔枝出口市场；
三是组织做好出口果园、加工厂的对外注册工作。建议国家质检总局对外开展保鲜荔枝输美国、澳大利亚热处理认可谈判，帮助企业开拓澳大利亚、美国市场。
荔枝的市场前景广阔，规模化种植前景看好，带动了经济效益，有着良好的发展空间。为了保证产业的发展，打破旧的种植观念，调整农业产业结构，帮助群众找到了新的增收路子。
