开发养殖蝇蛆还有更深远的利用价值。
①蝇蛆富含蛋白质，因而可利用蝇蛆提取蛋白质，用于食品工业、发酵工业、橡胶工业等；
②蝇蛆的氨基酸组成比较合理，因此可用来制取水解蛋白和氨基酸。氨基酸可用来作药品，治疗一些由于氨基酸缺乏而引起的疾病，也可以加工成保健食品，或作食品强化剂，还可用于制造化妆品；
③蝇蛆可直接加工蛋白活性粉，蝇蛆蛋白活性粉具有抗疲劳、抗辐射，延缓衰老、护肝、增强免疫力等作用，是较为理想的保健品；
④蝇蛆表皮和蛹壳可提取几丁质，几丁质为含氨多糖类天然生物活性物质，广泛应用于工业、医药、食品、日用化工、国防、环保、农业等诸多高新科技领域，其开发利用已越来越被国内外科学界、医学界、企业界所重视；
⑤利用蝇蛆可开发新型医药。家蝇具有独特的免疫功能，其体内含有一种强烈杀菌作用的“抗菌活性蛋白”，这种活性蛋白只有万分之一浓度就足以杀灭入侵的病菌。同时，其血淋巴中含有抗癌作用的凝集素。再者，蝇蛆体内还含有一种粪产碱菌，能抑制皮肤脓疮的多种病菌，并能促进表皮的生成和疮伤的愈合。此外，家蝇体内还含有2%～4%的磷脂，磷脂具有保护细胞膜，降血脂，防治心血管疾病等方面的作用，因此蝇蛆在医药开发方面前景广阔；
⑥蝇蛆及其养殖废弃物可开发促进作物生长复合肥及抗虫抗病能力的杀虫剂或抗病制剂。
