泥鳅受精卵的孵化方式很多，可在孵化池、孵化网箱和产卵池的静水中孵化；也可在孵化缸、孵化桶及孵化环道的流水中孵化；还可在网箱微流水中孵化。而与前面的孵化方式比较，采用网箱微流水孵化泥鳅受精卵效果好。
而泥鳅在孵化桶、孵化缸及孵化环道的流水中，因流速不好调控，而且孵化时间较长，费工耗时，往往孵化效果不理想；在孵化池、孵化网箱和产卵池的静水孵化中，又往往因没有新鲜水体流入，而整个孵化的时间均在这个水体，水质变坏或缺氧，导致孵化率低。采用网箱微流水孵化，可解决这些问题，网箱入水20厘米左右，阳光直射箱内，水温随光照延长而缓慢上升，受精卵发育较快，很少发生水霉病，孵化率一般为70％-80％，高的可达90％以上。这种方法放卵孵化密度不宜太大。
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采用网箱微流水孵化，网箱入水0.2米左右，阳光直射箱内，水温随光照延长而缓慢上升，受精卵发育较快，很少发生水霉病，孵化率一般在70%-80%之间，高的可达90%以上。
