进行林蛙系统分离育种的步骤：首先，要征集育种用的原始林蛙，主要是收集种蛙，亦可收集蛙卵，收集的数量可多些，便于从中选择优良的个体。第二，对被选中的优良个体进行个体随机交配产卵，混合放养。第三，再从混合放养的林蛙群中选择优良个体，随机交配，混合放养，这样经过若千代将选出优良种群。这种选择方法的优点是简单易行，不需大量设备，但是由于无法进行系统即谱系选择，对于遗传变异和不遗传变异无法区分，育种年限长。系统分离育种最初几代实行个体选择，随机交配，·混合放养。经过3—4代以后，开始建立家系，实行家系内交配，并以家系为单位分区试养，选择寸以家系选择为主，在入选的冢系中选择优良个体，近亲繁殖几代，使品种性状得以稳定。为了防止近亲交配的不利，在经过3—4代近亲交配以后，种群性状基本稳定，可以在同一家系再分成几个小系，实行不同小系交配。
