盐巴具有强烈的渗透及脱水作用，它通过改变寄生物的渗透压，而使其被抑制和杀灭，是鳗鱼养殖过程中常用的水产药物，如白苗期刺激红虫吐脏、鱼种下塘前的消毒、水霉病的防治、鳗鱼长途运输等等。现将其作用陈述如下：
1. 白苗放养时期。在经过长时间运输后，袋中水质恶化，氨氮、亚硝酸盐浓度升高，此时苗体较疲弱，在白苗投放到水泥池前，保持池内0.7%的盐度，一方面尽量减少环境因素对鳗苗的刺激性，使鳗苗平稳过渡，尽快恢复体质，另一方面可消毒池水和苗体，避免其受病菌或寄生虫的侵袭，从而显著提高成活率。
2. 白苗培育阶段。红虫经暂养、漂洗、爬活后，放于0.5-1%左右的盐水中浸浴10-15分钟，可刺激红虫吐脏，同时寄生于红虫体表的细菌及寄生虫等也会受刺激而死亡或脱落，从而大大降低了鳗苗受爱德华氏菌及其他病菌感染的几率。
3. 鱼种下塘消毒。鳗苗在培育到一定规格(约10g/尾)时，经选别后下塘前，可用1%食盐浸泡5-10分钟，可部分杀灭鳗鱼体表水霉菌、寄生虫和细菌，起到杀菌消毒作用，提高鱼种下塘后的成活率，此种消毒方法简便、费用低廉且安全。
4. 鳗鱼养殖过程中多种病害的预防与治疗。①日本鳗鳃肾炎。用0.5%～0.8%食盐水药浴，可防治鳃腺炎。②寄生虫病。使用0.4%浓度的盐水浸浴，可有效刺激虫体的脱落或包囊的形成，再经及时换水后排出鳗池，效果较好。③水霉或鳃霉病。对鳗苗、鳗种水霉病，用1%的食盐水浸洗15-30分钟;或保持池内0.5%盐巴浓度3天左右，可有效控制霉菌。④气泡病。先将原来池水部分排掉，注入新水，然后以1mg/L的盐水浓度全池遍洒食盐，连用2~3天即可治愈。⑤烂鳃、烂尾、脱黏、败血病。用0.5%～0.8%食盐水浸浴，可显著减低鳗鱼死亡率。另外，在鳗鱼发生重金属或有机磷中毒时，保持池内0.5%浓度的食盐，能在一定程度上缓解鳗鱼中毒症状。
5. 拌料投喂。食盐有助于消化，还有一定的杀菌作用，因此打料时可将盐巴(按0.5-1%饲料量添加)溶于打料水中，拌料投喂。一方面可刺激鳗鱼食欲，另外可以增加机体无机盐，起到补充营养、预防鱼病的作用。
6. 增加溶氧，控制亚硝酸盐的含量。食盐可增加水中的离子浓度，使悬浮的有机微粒及胶体成絮状物而沉降到池底，可减少溶氧消耗、净化水体。在土塘养殖过程中，如果发生泛池，若无增氧设备或来不及增氧，可向塘中泼洒10公斤/亩食盐，有一定效果。同时当水体中氯离子(clˉ)与亚硝态氮(NO2−N)浓度比为6:1时，可有效控制亚硝酸盐含量(每亩施用8-10公斤食盐及少量硫酸亚铁和碳酸钙)，从而防止鱼患高铁血红蛋白症。
另外，在鳗鱼养殖过程中盐巴还有其他的应用。例如在当年建造的白仔苗培育池中，新池泡水时常常加入1%盐巴，其目的是可加速退碱进程，使脱碱完全。在鳗鱼运输过程中，在水中加入0.2%～0.4%的食盐，以调节鱼体内外渗透压和防治鱼种外出血及感染，提高鳗鱼运输成活率。
