短途运输（路程５０公里以内）一般采用湿润法运输。运输容器可用木箱、木桶、麻袋、编织袋等，为了保持湿润，底部可铺垫一层湿草或湿蒲包、黏土甚至鸡蛋清，防止鳝体摩擦受伤。
使用木箱、木桶装运，要在四周和盖上打洞，以便通气。要避免阳光直射，夏季运输时还要注意降温，经常在桶盖、箱盖上放上冰块，盛放密度不宜超过４０公斤／立方米。当然采用带水运输法效果更好，盛放密度可达５０公斤／立方米，但成本较高，比较费事。
中途运输（路程５０～５００公里）一般采用带水法运输。运输容器可用木桶、帆布袋、水缸、泡沫箱、铁皮箱等。
鳝与水重量比为１∶１，天气炎热时将冰块放在网盖上，使融化的冰水滴入水中逐渐降温。同时按黄鳝重量１０％的比例放入泥鳅。
每立方米水中加入庆大霉素４０００万单位或金霉素１０克，并放入一些柔软的水草。盛放黄鳝的密度不宜超过４０公斤／立方米。
