日本自古以来就开始食用日本鳗。日本鳗传统上认为其是营养的来源，夏季的消费亦是极特殊的习俗，据说可以消除酷暑的身体疲劳。
现今日本消费量约10万公吨左右，占全球鳗鱼捕捞量的70-80％，但2013年日本环境部认定该物种面临灭绝的危机，国际保育联盟（IUCN）并于2014年6月将其列入濒危物种红皮书。在日本，鳗鱼产业养殖的成功极为重视，尤其大部分的鳗鱼是野外捕捉后进行养殖。然而，玻璃鳗苗的过度捕捞已成为重大问题。
鳗鱼通常12月至4月间可在太平洋沿岸捕获并放入装有加热装置及循环过滤系统的养殖槽，接受喂养和生活以提高生存机会。鳗鱼生活在水温23-28℃的池塘或专门养殖槽，尔后定期按大小分类直到成长达到市场价值的大小。
然而，尽管日本有鳗鱼养殖场，但因鳗鱼的生态、行为、产卵和生命史尚未获得很好的理解，所以养殖非常困难。解决此问题的各种研究正在进行，例如一系列之激素处理，包括转化性别（多数养殖鳗是雄性）。虽然最终结果是供给受精卵，也又涉及重复注射的风险。
据联合国粮农组织（FAO）所言，日本鳗鱼市场已接近饱和，但仍有想扩展至南韩和欧洲的潜力。鳗鱼市场缩小，可是日本、中国大陆及台湾国内仍大量养殖。
2014年日本、中国大陆、台湾及南韩制订的首次尝试管理的国际协议和同意藉由监控玻璃鳗采购限额来控制日本鳗资源量。依据协议，鳗鱼养殖场须向日本水产厅注册，以便该机构监控玻璃鳗的采购和运送量（日本玻璃鳗年度采购限额为21.6公吨）。
2015年4月水产厅启用许可制度，鳗鱼养殖户须取得官方养殖许可。该机构也促进国内外资源管理措施，并认知到有必要进一步加紧监控鳗鱼贸易。然而，尽管已采取显著行动，问题依然存在，例如偷捕和黑市交易皆可能威胁新法规的功效。
野生鳗鱼资源保育须持续努力且不该完全仰赖未来的人工养殖。无论日本是否让鳗鱼、鲔鱼或其他物种消失或采取行动来挽救其灭绝，取决于物种是否以永续性方式捕捞。
