蝲蛄对水质要求极高，生活在东北的山间河流里，被污染的水中不能存活(长白山红松林繁育地区曾因为防治松毛虫的农药被雨水冲进河中而导致蝲蛄几近灭亡，后来注重生态环保之后渐渐恢复)。
小龙虾则在南方的河沟等水里，对水质要求不高。活体蝲蛄是青褐色，活体小龙虾是偏红色的。蝲蛄的鳌和背部表面比较光滑，小龙虾的则有凹凸斑点。
产地区别
“蝲蛄(东北黑鳌虾)和小龙虾(克氏原鳌虾)是不同的动物，蝲蛄是中国东北原产的，小龙虾原产地在北美，经日本进入中国。
外形区别
1、小龙虾的外壳显褐白色，蝲蛄的外壳爲青绿色。
2、小龙虾的外壳带有分明甲刺和突痕，而蝲蛄表面润滑无分明凹凸和甲刺。
3、小龙虾的副足短粗，蝲蛄的副足细长。
4、小龙虾的头部大，蝲蛄的尾部大。
5、小龙虾泥土味浓郁滋味香腥，蝲蛄滋味鲜美口感微甜。
6、小龙虾的第一对螯多爲细长，且有分明的甲刺，蝲蛄则润滑丰满圆润。
蝲蛄的个体要比小龙虾小很多。蝲蛄背部的和小龙虾背部也有明显区别。
东北蝲蛄为原生物种，长不到小龙虾那样大，体暗褐，不同于小龙虾的血红色，第一对螯足也偏小。
二者对环境的需求不同，东北蝲蛄需要相对清澈无污染的水质。
栖息地区别
栖息环境不同，小龙虾为农田河岸打洞，东北蝲蛄则栖息与石块下与沙石缝中。
小龙虾对栖息水域环境要求不高，北方的很多细微净化的田间沟渠都可以正常存活，蝲蛄要求栖息水域条件几近苛刻，任何的净化都会使其形 成死亡灭绝，尤其对化学农药肥料敏感。
总的来说蝲蛄的体形相对短粗,尤其是头胸部和螯肢. 蝲蛄螯的内侧缘较光滑,克氏则有齿状棘突;蝲蛄的额剑接近正三角形,克氏则较细长,并 在基角处形成眼后棘。
