1．选种抗病品种。
2．种苗处理：2～3％石灰水浸种24小时；40％拌种双可湿性粉剂、40％拌种灵可湿性粉剂500倍液浸种10分钟，有一定的防治效果。
3.选择无病或少病种苗在热水处理的基础上建立无病苗圃，种植无病材料，或在田间选择无病的田块留种等方法可避免或减轻黑穗病的危害。
4.加强田间管理，及时施肥培土，促使蔗苗生长健壮，增强蔗株的抗病力。
5.及时拔除病株（注意掌握在黑穗抽出前或鞭状物的白膜未破裂前拔出），并集中烧毁。
6.重病区减少宿根年限，加强与水稻、玉米、甘薯、花生等非感病作物轧作。
