1、幼虫活体常温储存
在20-30度常温下，苍蝇幼虫可以实现7-10天左右的存活。不过，由于幼虫不断活动，每天将消耗掉身体重量的约10%的营养物质。因此，本方法只适用于3天内的苍蝇幼虫短时活体存储。本方法成本低，但不能长期保存。
2.幼虫活体冷藏储存
苍蝇幼虫在5-15度的低温下，新陈代谢降低，可以存活1-3个月。利用专用的冷藏专车，可以实现苍蝇幼虫的长距离活体运输，并且几乎不损失营养。优点是昆虫可以活体保鲜，成本适中。
利用本方法储存苍蝇，需要建设专门的保险冷藏库，活虫保鲜成本为0.05元/kg/天。利用此方法，由于保鲜成本随着保存时间而增加，因此适用于幼虫活体养殖在一个月内的存储。
3、幼虫冷冻储存
将苍蝇幼虫冷冻保鲜，不会变质。解冻后幼虫不再具有活体状态，利用此方法储存，成本约为0.1元/kg/天。
4.幼虫烘干储存
将苍蝇幼虫烘干以进行长时间保存。该方法得到的苍蝇虫干在常温下通常具有半年以上的保鲜期，缺点是短时成本高昂。幼虫烘干成为为2-4元/kg。
